El exfuncionario es señalado como presunto responsable por los delitos de tortura, desaparición forzada de personas 

Un juez federal negó a Tomás Zerón de Lucio un amparo para frenar la orden de aprehensión en su contra por el Caso Ayotzinapa.
La Fiscalía General de la República (FGR) acusa al exfuncionario como presunto responsable de los delitos de tortura, desaparición forzada de personas y contra la administración de la justicia.
José Fernando García Quiroz, Juez Octavo de Distrito en materia de Amparo y Juicios Federales, rechazó la medida legal dentro de la causa penal 112/2020.
contra la administración de la justicia en el marco del Caso Ayotzinapa.
En su demanda, Zerón de Lucio alegó que su presencia en el Río San Juan, de Cocula el 28 de octubre de 2014, fue apegada a la ley.
En dicha diligencia se localizó una bolsa de plástico con restos óseos, a partir de una declaración de Agustín García Reyes, El Chereje, uno de los presuntos jefes de sicarios de Guerreros Unidos.
También cuestionó las declaraciones del Chereje y de la actuación del titular de la Unidad de Investigación y Litigación del Caso Ayotzinapa, Omar Gómez Trejo, quien ordenó la integración de diversas investigaciones por la desaparición de los estudiantes.
Señaló que antes de desempeñar el cargo de fiscal, Gómez Trejo fungió como secretario ejecutivo del Grupo Interdisciplinario de Expertos Independientes (GIEI), motivo por el cual existe una causal de impedimento para llevar a cabo funciones de investigación.
Pese a ello, el juzgador declaró infundados los alegatos del exfuncionario de la entonces Procuraduría General de la República (PGR), y señaló que el GIEI fue creado por Comisión Interamericana de Derechos Humanos (CIDH) para brindar asistencia técnica internacional, cuyo objetivo principal de sus integrantes era la de ser fiscalizadores de las acciones concretas desarrolladas por el Estado.
El juzgador puntualizó que la función de Omar Gómez como secretario ejecutivo del GIEI y como actual titular de la Unidad de Investigación son diferentes.